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Altounian/Science 　　肿瘤是世界上导致死亡的首要原因之一。目前，科研人员对只占人类基因组2%的编码蛋白的基因有深入的研究，但是对非编码基因组部分和肿瘤中的基因调控的研究仍然很少。癌症基因组图谱（TCGA）是一个致力于加快对癌症分子基础的研究的组织。它系统性地收集了大量与人类癌症组织相关的DNA突变，甲基化，RNA表达和其它分子生物学信息。斯坦福大学的研究人员利用对TCGA中410个癌症样本的测序构建了癌症染色质可及性的图谱。这一图谱可以描绘出从表观遗传学水平上对基因表达的调控。通过将这一信息与同一肿瘤样本的其它组学信息相比较，研究人员发现众多与癌症发病风险和患者生存相关的突变信息。这些DNA序列的变异虽然不影响蛋白的功能，但是对癌症的临床预后有重要影响。 　　相关论文：Corces, et al., (2018). The chromatin accessibility landscape of primary human cancers Science, 　　《Science Translational Medicine》：治疗髓母细胞瘤的新药物 　　髓母细胞瘤是小儿中较常见的颅内肿瘤，它是中枢神经系统恶性程度最高的肿瘤之一。髓母细胞瘤的group 3和group 4亚型异质性非常强，导致它们很难被靶向治疗，因此患者生存率很低。休斯顿卫理公会研究所和癌症中心的研究人员利用系统生物学的方法发现一种已经获得批准的药物可以治疗这类癌症亚型。在小鼠肿瘤模型中使用这种称为地高辛（digoxin）的药物可以延长小鼠生存期，而且将它与放疗联合使用可以得到更好的效果。这项研究可能为这一难治性癌症患者提供新的治疗方法。 　　相关论文：Huang, et al., (2018). Systems biologybased drug repositioning identifies digoxin as a potential therapy for groups 3 and 4 medulloblastoma, 　　《Science Signaling》：调控眼皮形态发育的机制 　　图片来源：Bian et Signaling 　　在很多哺乳动物中，为了防止眼睛在出生时或出生后的早期发育过程中不受损伤，眼皮会完全盖住角膜并且融合在一起。但是调控这一发育过程的机制还未得到澄清。西安第四军医大学的研究人员使用小鼠遗传模型和体外组织培养实验，证明一种称为鞘氨醇1-磷酸（S1P）的脂类能够促进眼皮融合。它通过刺激表皮生长因子受体的信号通路，激活影响细胞迁移的蛋白。这项研究揭示了调控细胞迁移和眼皮融合的复杂信号通路。 　　相关论文：Bian et al., (2018Sphingosine 1-phosphate stimulates eyelid closure in the developing rat by stimulating EGFR signaling, 　　《自然》：婴儿的肠道菌群生长与糖尿病的关系 　　图片来源：Alberto Seveso 　　婴儿在出生之后肠道菌群的生长被认为和诸如1型糖尿病等疾病的病理发生有关。但是，我们对婴儿在出生后肠道菌群的生长并不十分了解。本期《自然》发表的两篇论文对婴儿的肠道菌群在出生后的发育和1型糖尿病婴儿的肠道菌群的特征进行了研究。研究结果表明，母乳对婴儿在出生后早期的肠道菌群生长有很重要的影响。而将健康婴儿的肠道菌群与1型糖尿病婴儿的肠道菌群进行比较，研究人员发现健康婴儿的肠道菌群中包含更多与短链脂肪酸的合成和发酵相关的基因。这一发现意味着短链脂肪酸可能有预防1型糖尿病的作用。 　　相关论文：Stewart et al., (2018). Temporal development of the gut microbiome in early childhood from the TEDDY study. Nature, 　　Vatanen et al., (2018). The human gut microbiome in early-onset type 1 diabetes from the TEDDY study. Nature, 95%的人还看了： 　　原标题：SCI论文写作: 写论文一定要有提纲 　　前言： 　　先引用浙大化学系唐睿康教授在专业英语课上的一句话：“论文写作，如果简单地说说，10分钟就讲完了；如果要仔细解读，讲个几年都可以！” 在这里，咱们尝试着仔细来解读解读，希望对大家有所帮助，也欢迎更多经验丰富的前辈不吝指正！ 　　1. 为什么要写提纲？ 　　对于一篇好的论文，好的数据只能算30%，而怎样把它以一种精彩的方式表述出来占了70%，所以同样的内容，由不同人来写，可能会有不同的效果。当然，谁都希望有个好的publication，不是么？所以，努力锻炼论文写作能力是很有必要的。那么对于一篇论文而言，最难的部分是什么呢？文章结构！ 　　对于一篇文章而言，怎样保证它有一个清晰合理的结构，最终能够变成一篇逻辑性很强的论文呢？一条重要的建议：每次写论文之前，请写好提纲，仔细跟自己的导师（如果你还是学生的话）讨论下文章的框架，到底这个工作突出什么，从哪个角度进行切入，哪些数据需要放到正文等等。 　　写好提纲跟导师讨论完框架之后再进行写作，可以极大地减少这篇文章在你和导师之间来回的次数，也能够尽快地让这篇文章达到导师所满意的程度。从改论文的人的角度来说，语言烂一点，憋口气还能忍，如果逻辑关系很差，框架很乱，那么是绝对没法愉快地进行修改的。所以，有的时候，不要怪导师改论文慢，提前花点时间讨论下文章结构是非常有必要的。而提纲是最好的方式！ 　　I emphasize the central place of an outline in writing papers, preparing seminars, and planning research.George M. Whitesides 　　研究永无止境，写提纲要趁早，实际上，小编鼓励大家在论文主要数据完成之后就开始写提纲，这样其实有利于完善你的课题，让你清晰地知道还有哪些东西需要补充。 　　2. 怎样来写论文提纲呢？ 　　说到这个问题，请允许小编推荐下神人Whitesides的这篇Advanced Materials (Adv. Mater. 2004, 16, 1375), 论文题目是: Whitesides Group: Writing a paper. 这个可爱的老者不仅仅是多个领域的开创者，众多牛人的导师，学术界的泰斗，同时在论文写作这个方面也曾写过很多对大家有帮助的东西，包括他整理的The elements of style等。 　　A. 提纲写法第一准则：文字简练 　　提纲写法可能稍微有点差异，但不管是那种都不要写太多的文字，因为它只是帮助你来构建你的文章框架而言，完全用不着那么多语言。简单来说，提纲的作用就是告诉你：这个部分我需要写进去，有哪些东西可能用得上。 　　B. 论文提纲怎么写？ 　　论文提纲是论文的缩影，因此它的基本结构和论文结构是一样的。 　　Title：应该有个简单的题目，后面再进行修正 　　Abstract： 可以等论文写好了再进行补充 　　Introduction 部分：提纲中主要回答两个问题：1) Why did I do the work? What were the central motivations and hypotheses?为什么做，在做这个课题的时候是基于怎样的动机和假说. 　　具体而言，它包括以下几个层次： 　　1) 研究目标 　　2) 为什么这个研究目标很重要？ 　　3) 研究背景：有谁做过，怎么做的？我们之前做过啥研究？（备注：不需要很详细，比如谁做过，写个作者的名字就行了，你自己知道是哪篇文献就好） 　　4) 指引作者：这篇文章重点该看啥？有哪些有意思的点？我们采用了怎样的策略？ 　　5) 结论：读者从文章中可以期待怎样的结论？ 　　Experimental section部分：对于详尽版的提纲，这个部分应该列出小标题，如仪器表征，要列出需要写到文中的仪器有哪些等等。 　　Results and discussion部分：这个部分应该根据文章主题进行组织。一般将文中要用到的图表都放上去，然后筛选出哪些特别重要的，放在这个位置，到时候可以结合这些图表去跟导师讨论，这样目的性更明确，同时，导师也能够给出对于作图方面不足之处的建议等等。这里要注意，这些数据应该按重要性进行排序，而不是根据做实验的时间先后进行排序。 　　提纲写法第二准则：能用图说清楚的时候一定用图，不要采用纯文字 　　Conclusion部分：采用短语或者短句将文章的主要结论列出来。不要重复Result部分已经列出来的结论，除非有必要作特殊强调。结论不是简单地总结，而是对论文的重要性进行升华。 　　C. 实例展示 　　纸上谈兵总是很难让大家学到东西的，这里小编简单地放一个例子（Chem. Mater. 2015, 27, 8011?8020），希望能够让大家明白上述这些要点。 　　来源 | 研之成理（ID：rationalscience） 　　责任编辑： 。
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